Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH1

TTLL11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, humanhuman

Predictions only

Length 800 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL11Q8NHH1 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTLL11Q8NHH1 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTLL11Q8NHH1 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms