Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR7

CCDC148, Coiled-coil domain-containing protein 148, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC148Q8NFR7 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCDC148Q8NFR7 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC148Q8NFR7 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC148Q8NFR7 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC148Q8NFR7 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC148Q8NFR7 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC148Q8NFR7 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC148Q8NFR7 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC148Q8NFR7 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC148Q8NFR7 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC148Q8NFR7 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC148Q8NFR7 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC148Q8NFR7 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC148Q8NFR7 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC148Q8NFR7 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC148Q8NFR7 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC148Q8NFR7 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC148Q8NFR7 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC148Q8NFR7 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC148Q8NFR7 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC148Q8NFR7 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC148Q8NFR7 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC148Q8NFR7 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC148Q8NFR7 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC148Q8NFR7 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC148Q8NFR7 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC148Q8NFR7 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC148Q8NFR7 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC148Q8NFR7 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC148Q8NFR7 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC148Q8NFR7 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC148Q8NFR7 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC148Q8NFR7 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC148Q8NFR7 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC148Q8NFR7 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC148Q8NFR7 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC148Q8NFR7 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC148Q8NFR7 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC148Q8NFR7 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC148Q8NFR7 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC148Q8NFR7 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC148Q8NFR7 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC148Q8NFR7 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC148Q8NFR7 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC148Q8NFR7 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC148Q8NFR7 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC148Q8NFR7 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC148Q8NFR7 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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