Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEM8

AGBL3, Cytosolic carboxypeptidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGBL3Q8NEM8 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
AGBL3Q8NEM8 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGBL3Q8NEM8 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGBL3Q8NEM8 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGBL3Q8NEM8 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGBL3Q8NEM8 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGBL3Q8NEM8 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGBL3Q8NEM8 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGBL3Q8NEM8 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGBL3Q8NEM8 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGBL3Q8NEM8 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGBL3Q8NEM8 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGBL3Q8NEM8 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGBL3Q8NEM8 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGBL3Q8NEM8 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGBL3Q8NEM8 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGBL3Q8NEM8 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGBL3Q8NEM8 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGBL3Q8NEM8 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGBL3Q8NEM8 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGBL3Q8NEM8 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGBL3Q8NEM8 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
AGBL3Q8NEM8 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGBL3Q8NEM8 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGBL3Q8NEM8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGBL3Q8NEM8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGBL3Q8NEM8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGBL3Q8NEM8 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGBL3Q8NEM8 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGBL3Q8NEM8 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGBL3Q8NEM8 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGBL3Q8NEM8 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGBL3Q8NEM8 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGBL3Q8NEM8 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGBL3Q8NEM8 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGBL3Q8NEM8 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
AGBL3Q8NEM8 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
AGBL3Q8NEM8 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
AGBL3Q8NEM8 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
AGBL3Q8NEM8 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGBL3Q8NEM8 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGBL3Q8NEM8 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGBL3Q8NEM8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGBL3Q8NEM8 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGBL3Q8NEM8 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGBL3Q8NEM8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGBL3Q8NEM8 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGBL3Q8NEM8 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGBL3Q8NEM8 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGBL3Q8NEM8 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGBL3Q8NEM8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGBL3Q8NEM8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGBL3Q8NEM8 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGBL3Q8NEM8 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
AGBL3Q8NEM8 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms