Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CARMIL3Q8ND23 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CARMIL3Q8ND23 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms