Protein–RNA interactions for Protein: Q8N616

LINC00311, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00311, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00311Q8N616 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00311Q8N616 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00311Q8N616 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00311Q8N616 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00311Q8N616 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00311Q8N616 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00311Q8N616 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00311Q8N616 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00311Q8N616 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00311Q8N616 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00311Q8N616 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00311Q8N616 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00311Q8N616 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00311Q8N616 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00311Q8N616 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00311Q8N616 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00311Q8N616 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00311Q8N616 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00311Q8N616 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00311Q8N616 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00311Q8N616 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00311Q8N616 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00311Q8N616 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00311Q8N616 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00311Q8N616 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00311Q8N616 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00311Q8N616 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00311Q8N616 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00311Q8N616 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00311Q8N616 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00311Q8N616 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00311Q8N616 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00311Q8N616 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00311Q8N616 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00311Q8N616 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00311Q8N616 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00311Q8N616 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00311Q8N616 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00311Q8N616 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00311Q8N616 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00311Q8N616 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00311Q8N616 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00311Q8N616 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00311Q8N616 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00311Q8N616 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00311Q8N616 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00311Q8N616 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00311Q8N616 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00311Q8N616 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00311Q8N616 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00311Q8N616 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00311Q8N616 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00311Q8N616 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00311Q8N616 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00311Q8N616 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00311Q8N616 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00311Q8N616 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00311Q8N616 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00311Q8N616 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00311Q8N616 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00311Q8N616 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00311Q8N616 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00311Q8N616 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00311Q8N616 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00311Q8N616 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00311Q8N616 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00311Q8N616 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00311Q8N616 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00311Q8N616 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00311Q8N616 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00311Q8N616 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00311Q8N616 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00311Q8N616 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00311Q8N616 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00311Q8N616 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00311Q8N616 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00311Q8N616 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00311Q8N616 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00311Q8N616 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00311Q8N616 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00311Q8N616 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00311Q8N616 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00311Q8N616 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00311Q8N616 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00311Q8N616 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00311Q8N616 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00311Q8N616 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00311Q8N616 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00311Q8N616 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00311Q8N616 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00311Q8N616 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00311Q8N616 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00311Q8N616 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00311Q8N616 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00311Q8N616 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00311Q8N616 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00311Q8N616 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00311Q8N616 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00311Q8N616 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00311Q8N616 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms