Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Q1

FAM71E2, Protein FAM71E2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71E2Q8N5Q1 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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FAM71E2Q8N5Q1 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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FAM71E2Q8N5Q1 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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FAM71E2Q8N5Q1 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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FAM71E2Q8N5Q1 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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FAM71E2Q8N5Q1 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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FAM71E2Q8N5Q1 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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FAM71E2Q8N5Q1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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FAM71E2Q8N5Q1 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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FAM71E2Q8N5Q1 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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FAM71E2Q8N5Q1 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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FAM71E2Q8N5Q1 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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FAM71E2Q8N5Q1 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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FAM71E2Q8N5Q1 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM71E2Q8N5Q1 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms