Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYNE4Q8N205 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYNE4Q8N205 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SYNE4Q8N205 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYNE4Q8N205 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYNE4Q8N205 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYNE4Q8N205 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYNE4Q8N205 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYNE4Q8N205 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYNE4Q8N205 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYNE4Q8N205 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYNE4Q8N205 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYNE4Q8N205 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYNE4Q8N205 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYNE4Q8N205 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYNE4Q8N205 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYNE4Q8N205 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SYNE4Q8N205 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYNE4Q8N205 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYNE4Q8N205 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SYNE4Q8N205 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYNE4Q8N205 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYNE4Q8N205 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYNE4Q8N205 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYNE4Q8N205 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYNE4Q8N205 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYNE4Q8N205 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYNE4Q8N205 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYNE4Q8N205 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYNE4Q8N205 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYNE4Q8N205 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNE4Q8N205 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms