Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z333

SETX, Probable helicase senataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,677 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETXQ7Z333 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SETXQ7Z333 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SETXQ7Z333 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SETXQ7Z333 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SETXQ7Z333 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SETXQ7Z333 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SETXQ7Z333 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SETXQ7Z333 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SETXQ7Z333 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SETXQ7Z333 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SETXQ7Z333 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SETXQ7Z333 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SETXQ7Z333 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SETXQ7Z333 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SETXQ7Z333 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SETXQ7Z333 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SETXQ7Z333 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SETXQ7Z333 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SETXQ7Z333 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SETXQ7Z333 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SETXQ7Z333 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SETXQ7Z333 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SETXQ7Z333 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SETXQ7Z333 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SETXQ7Z333 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SETXQ7Z333 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SETXQ7Z333 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SETXQ7Z333 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SETXQ7Z333 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SETXQ7Z333 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SETXQ7Z333 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SETXQ7Z333 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SETXQ7Z333 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SETXQ7Z333 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SETXQ7Z333 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SETXQ7Z333 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SETXQ7Z333 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
SETXQ7Z333 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SETXQ7Z333 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SETXQ7Z333 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SETXQ7Z333 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SETXQ7Z333 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SETXQ7Z333 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SETXQ7Z333 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SETXQ7Z333 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SETXQ7Z333 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SETXQ7Z333 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SETXQ7Z333 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SETXQ7Z333 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SETXQ7Z333 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SETXQ7Z333 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SETXQ7Z333 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SETXQ7Z333 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SETXQ7Z333 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SETXQ7Z333 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SETXQ7Z333 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SETXQ7Z333 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SETXQ7Z333 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SETXQ7Z333 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SETXQ7Z333 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SETXQ7Z333 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SETXQ7Z333 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SETXQ7Z333 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SETXQ7Z333 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SETXQ7Z333 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SETXQ7Z333 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SETXQ7Z333 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SETXQ7Z333 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SETXQ7Z333 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SETXQ7Z333 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SETXQ7Z333 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SETXQ7Z333 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SETXQ7Z333 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SETXQ7Z333 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SETXQ7Z333 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SETXQ7Z333 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SETXQ7Z333 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SETXQ7Z333 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SETXQ7Z333 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SETXQ7Z333 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SETXQ7Z333 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SETXQ7Z333 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SETXQ7Z333 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SETXQ7Z333 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SETXQ7Z333 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SETXQ7Z333 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SETXQ7Z333 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SETXQ7Z333 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SETXQ7Z333 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SETXQ7Z333 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SETXQ7Z333 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SETXQ7Z333 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SETXQ7Z333 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SETXQ7Z333 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SETXQ7Z333 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SETXQ7Z333 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SETXQ7Z333 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SETXQ7Z333 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SETXQ7Z333 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SETXQ7Z333 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms