Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
STRCQ7RTU9 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC27■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC27■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
STRCQ7RTU9 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms