Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BHLHA9Q7RTU4 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms