Protein–RNA interactions for Protein: Q709F0

ACAD11, Acyl-CoA dehydrogenase family member 11, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAD11Q709F0 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACAD11Q709F0 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms