Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC149Q6ZUS6 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC149Q6ZUS6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC149Q6ZUS6 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC149Q6ZUS6 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC149Q6ZUS6 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC149Q6ZUS6 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC149Q6ZUS6 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC149Q6ZUS6 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC149Q6ZUS6 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC149Q6ZUS6 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC149Q6ZUS6 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC149Q6ZUS6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC149Q6ZUS6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC149Q6ZUS6 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC149Q6ZUS6 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC149Q6ZUS6 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC149Q6ZUS6 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC149Q6ZUS6 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC149Q6ZUS6 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC149Q6ZUS6 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC149Q6ZUS6 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC149Q6ZUS6 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC149Q6ZUS6 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC149Q6ZUS6 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC149Q6ZUS6 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC149Q6ZUS6 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC149Q6ZUS6 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC149Q6ZUS6 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC149Q6ZUS6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC149Q6ZUS6 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC149Q6ZUS6 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC149Q6ZUS6 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC149Q6ZUS6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC149Q6ZUS6 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC149Q6ZUS6 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC149Q6ZUS6 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC149Q6ZUS6 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC149Q6ZUS6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC149Q6ZUS6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC149Q6ZUS6 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC149Q6ZUS6 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC149Q6ZUS6 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC149Q6ZUS6 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC149Q6ZUS6 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC149Q6ZUS6 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC149Q6ZUS6 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC149Q6ZUS6 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC149Q6ZUS6 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC149Q6ZUS6 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC149Q6ZUS6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC149Q6ZUS6 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms