Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBR3Q6ZT12 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
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