Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00299Q6ZSB3 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms