Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CASC2Q6XLA1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms