Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMARCD3Q6STE5 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms