Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LETMD1Q6P1Q0 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LETMD1Q6P1Q0 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms