Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUI1

CCDC144NL, Putative coiled-coil domain-containing protein 144 N-terminal-like, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144NLQ6NUI1 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms