Protein–RNA interactions for Protein: Q6GMV2

SMYD5, SET and MYND domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD5Q6GMV2 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMYD5Q6GMV2 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMYD5Q6GMV2 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMYD5Q6GMV2 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMYD5Q6GMV2 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMYD5Q6GMV2 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMYD5Q6GMV2 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMYD5Q6GMV2 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMYD5Q6GMV2 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMYD5Q6GMV2 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SMYD5Q6GMV2 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMYD5Q6GMV2 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMYD5Q6GMV2 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SMYD5Q6GMV2 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMYD5Q6GMV2 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMYD5Q6GMV2 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMYD5Q6GMV2 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMYD5Q6GMV2 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMYD5Q6GMV2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMYD5Q6GMV2 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMYD5Q6GMV2 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMYD5Q6GMV2 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMYD5Q6GMV2 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMYD5Q6GMV2 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMYD5Q6GMV2 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMYD5Q6GMV2 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMYD5Q6GMV2 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMYD5Q6GMV2 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMYD5Q6GMV2 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMYD5Q6GMV2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMYD5Q6GMV2 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMYD5Q6GMV2 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SMYD5Q6GMV2 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMYD5Q6GMV2 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMYD5Q6GMV2 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SMYD5Q6GMV2 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMYD5Q6GMV2 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMYD5Q6GMV2 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SMYD5Q6GMV2 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMYD5Q6GMV2 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMYD5Q6GMV2 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SMYD5Q6GMV2 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMYD5Q6GMV2 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMYD5Q6GMV2 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMYD5Q6GMV2 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SMYD5Q6GMV2 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMYD5Q6GMV2 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SMYD5Q6GMV2 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMYD5Q6GMV2 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMYD5Q6GMV2 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMYD5Q6GMV2 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMYD5Q6GMV2 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMYD5Q6GMV2 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMYD5Q6GMV2 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMYD5Q6GMV2 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMYD5Q6GMV2 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMYD5Q6GMV2 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMYD5Q6GMV2 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMYD5Q6GMV2 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMYD5Q6GMV2 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMYD5Q6GMV2 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMYD5Q6GMV2 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMYD5Q6GMV2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMYD5Q6GMV2 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SMYD5Q6GMV2 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMYD5Q6GMV2 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMYD5Q6GMV2 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SMYD5Q6GMV2 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMYD5Q6GMV2 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMYD5Q6GMV2 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMYD5Q6GMV2 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMYD5Q6GMV2 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMYD5Q6GMV2 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMYD5Q6GMV2 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMYD5Q6GMV2 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMYD5Q6GMV2 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SMYD5Q6GMV2 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMYD5Q6GMV2 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMYD5Q6GMV2 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMYD5Q6GMV2 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
SMYD5Q6GMV2 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMYD5Q6GMV2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMYD5Q6GMV2 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMYD5Q6GMV2 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMYD5Q6GMV2 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMYD5Q6GMV2 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMYD5Q6GMV2 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMYD5Q6GMV2 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMYD5Q6GMV2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMYD5Q6GMV2 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SMYD5Q6GMV2 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMYD5Q6GMV2 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMYD5Q6GMV2 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMYD5Q6GMV2 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMYD5Q6GMV2 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMYD5Q6GMV2 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMYD5Q6GMV2 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMYD5Q6GMV2 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMYD5Q6GMV2 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMYD5Q6GMV2 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms