Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
INTS3Q68E01 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
INTS3Q68E01 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
INTS3Q68E01 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
INTS3Q68E01 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
INTS3Q68E01 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms