Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM3

PRAMEF18, PRAME family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF18Q5VWM3 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms