Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW36

FOCAD, Focadhesin, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOCADQ5VW36 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FOCADQ5VW36 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms