Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW22

AGAP6, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP6Q5VW22 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AGAP6Q5VW22 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms