Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 KATNBL1P2-201ENST00000433311 835 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms