Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HES3Q5TGS1 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HES3Q5TGS1 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HES3Q5TGS1 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HES3Q5TGS1 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HES3Q5TGS1 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HES3Q5TGS1 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HES3Q5TGS1 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HES3Q5TGS1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HES3Q5TGS1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HES3Q5TGS1 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HES3Q5TGS1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HES3Q5TGS1 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HES3Q5TGS1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HES3Q5TGS1 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HES3Q5TGS1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HES3Q5TGS1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HES3Q5TGS1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HES3Q5TGS1 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HES3Q5TGS1 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HES3Q5TGS1 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HES3Q5TGS1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HES3Q5TGS1 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HES3Q5TGS1 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms