Protein–RNA interactions for Protein: Q5T9A4

ATAD3B, ATPase family AAA domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3BQ5T9A4 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATAD3BQ5T9A4 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATAD3BQ5T9A4 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms