Protein–RNA interactions for Protein: Q5JV73

FRMPD3, FERM and PDZ domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,810 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD3Q5JV73 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FRMPD3Q5JV73 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FRMPD3Q5JV73 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
FRMPD3Q5JV73 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
FRMPD3Q5JV73 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FRMPD3Q5JV73 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
FRMPD3Q5JV73 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
FRMPD3Q5JV73 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
FRMPD3Q5JV73 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
FRMPD3Q5JV73 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
FRMPD3Q5JV73 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FRMPD3Q5JV73 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
FRMPD3Q5JV73 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FRMPD3Q5JV73 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FRMPD3Q5JV73 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
FRMPD3Q5JV73 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
FRMPD3Q5JV73 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FRMPD3Q5JV73 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FRMPD3Q5JV73 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FRMPD3Q5JV73 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
FRMPD3Q5JV73 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FRMPD3Q5JV73 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FRMPD3Q5JV73 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FRMPD3Q5JV73 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FRMPD3Q5JV73 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FRMPD3Q5JV73 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FRMPD3Q5JV73 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FRMPD3Q5JV73 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FRMPD3Q5JV73 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FRMPD3Q5JV73 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FRMPD3Q5JV73 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FRMPD3Q5JV73 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FRMPD3Q5JV73 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FRMPD3Q5JV73 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FRMPD3Q5JV73 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FRMPD3Q5JV73 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FRMPD3Q5JV73 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FRMPD3Q5JV73 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FRMPD3Q5JV73 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FRMPD3Q5JV73 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FRMPD3Q5JV73 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FRMPD3Q5JV73 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FRMPD3Q5JV73 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FRMPD3Q5JV73 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FRMPD3Q5JV73 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FRMPD3Q5JV73 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FRMPD3Q5JV73 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FRMPD3Q5JV73 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FRMPD3Q5JV73 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FRMPD3Q5JV73 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FRMPD3Q5JV73 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FRMPD3Q5JV73 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FRMPD3Q5JV73 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FRMPD3Q5JV73 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FRMPD3Q5JV73 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FRMPD3Q5JV73 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FRMPD3Q5JV73 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FRMPD3Q5JV73 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FRMPD3Q5JV73 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FRMPD3Q5JV73 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FRMPD3Q5JV73 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FRMPD3Q5JV73 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FRMPD3Q5JV73 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FRMPD3Q5JV73 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FRMPD3Q5JV73 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FRMPD3Q5JV73 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FRMPD3Q5JV73 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FRMPD3Q5JV73 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FRMPD3Q5JV73 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FRMPD3Q5JV73 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FRMPD3Q5JV73 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms