Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PITRM1Q5JRX3 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PITRM1Q5JRX3 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PITRM1Q5JRX3 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PITRM1Q5JRX3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PITRM1Q5JRX3 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PITRM1Q5JRX3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PITRM1Q5JRX3 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PITRM1Q5JRX3 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PITRM1Q5JRX3 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PITRM1Q5JRX3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PITRM1Q5JRX3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PITRM1Q5JRX3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PITRM1Q5JRX3 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PITRM1Q5JRX3 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PITRM1Q5JRX3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PITRM1Q5JRX3 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PITRM1Q5JRX3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PITRM1Q5JRX3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PITRM1Q5JRX3 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PITRM1Q5JRX3 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PITRM1Q5JRX3 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PITRM1Q5JRX3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PITRM1Q5JRX3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PITRM1Q5JRX3 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PITRM1Q5JRX3 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PITRM1Q5JRX3 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PITRM1Q5JRX3 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PITRM1Q5JRX3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PITRM1Q5JRX3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PITRM1Q5JRX3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PITRM1Q5JRX3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PITRM1Q5JRX3 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PITRM1Q5JRX3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PITRM1Q5JRX3 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PITRM1Q5JRX3 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PITRM1Q5JRX3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PITRM1Q5JRX3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PITRM1Q5JRX3 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PITRM1Q5JRX3 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PITRM1Q5JRX3 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PITRM1Q5JRX3 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PITRM1Q5JRX3 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PITRM1Q5JRX3 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PITRM1Q5JRX3 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PITRM1Q5JRX3 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PITRM1Q5JRX3 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PITRM1Q5JRX3 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PITRM1Q5JRX3 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PITRM1Q5JRX3 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PITRM1Q5JRX3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PITRM1Q5JRX3 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PITRM1Q5JRX3 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PITRM1Q5JRX3 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
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