Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CAVIN4Q5BKX8 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAVIN4Q5BKX8 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms