Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C4orf17Q53FE4 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
C4orf17Q53FE4 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms