Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC38Q502W7 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms