Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ISXQ2M1V0 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ISXQ2M1V0 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms