Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GEN1Q17RS7 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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GEN1Q17RS7 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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GEN1Q17RS7 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GEN1Q17RS7 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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