Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC142Q17RM4 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC142Q17RM4 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
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