Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 LRRIQ3-203ENST00000370911 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 AC005014.3-201ENST00000605985 190 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 AC090515.5-201ENST00000560378 526 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 AL157762.1-201ENST00000619612 415 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 MTCO1P15-201ENST00000529569 1526 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 MTND2P11-201ENST00000423638 648 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 AL353708.1-201ENST00000567904 1257 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 AC121493.1-201ENST00000602316 450 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 AC090506.2-201ENST00000624521 419 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
FOXD1Q16676 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
FOXD1Q16676 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
FOXD1Q16676 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
FOXD1Q16676 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FOXD1Q16676 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FOXD1Q16676 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FOXD1Q16676 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FOXD1Q16676 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FOXD1Q16676 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FOXD1Q16676 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FOXD1Q16676 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FOXD1Q16676 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FOXD1Q16676 AL157938.2-207ENST00000415391 884 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FOXD1Q16676 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FOXD1Q16676 AC020611.2-201ENST00000535594 671 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FOXD1Q16676 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FOXD1Q16676 AC012309.1-203ENST00000585860 965 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FOXD1Q16676 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FOXD1Q16676 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FOXD1Q16676 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FOXD1Q16676 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
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