Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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