Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDB1Q16531 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDB1Q16531 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
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