Protein–RNA interactions for Protein: Q16515

ASIC2, Acid-sensing ion channel 2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC2Q16515 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ASIC2Q16515 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms