Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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GABRA6Q16445 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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GABRA6Q16445 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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GABRA6Q16445 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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GABRA6Q16445 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GABRA6Q16445 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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