Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN9AQ15858 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN9AQ15858 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN9AQ15858 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN9AQ15858 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN9AQ15858 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN9AQ15858 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN9AQ15858 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN9AQ15858 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN9AQ15858 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN9AQ15858 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN9AQ15858 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN9AQ15858 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN9AQ15858 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN9AQ15858 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN9AQ15858 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN9AQ15858 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN9AQ15858 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN9AQ15858 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN9AQ15858 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN9AQ15858 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN9AQ15858 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN9AQ15858 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN9AQ15858 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN9AQ15858 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN9AQ15858 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN9AQ15858 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN9AQ15858 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN9AQ15858 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN9AQ15858 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN9AQ15858 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCN9AQ15858 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN9AQ15858 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN9AQ15858 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN9AQ15858 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN9AQ15858 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN9AQ15858 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN9AQ15858 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN9AQ15858 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN9AQ15858 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN9AQ15858 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN9AQ15858 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN9AQ15858 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN9AQ15858 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN9AQ15858 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN9AQ15858 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN9AQ15858 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN9AQ15858 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN9AQ15858 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCN9AQ15858 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCN9AQ15858 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCN9AQ15858 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCN9AQ15858 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCN9AQ15858 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCN9AQ15858 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCN9AQ15858 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCN9AQ15858 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCN9AQ15858 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCN9AQ15858 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCN9AQ15858 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCN9AQ15858 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCN9AQ15858 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SCN9AQ15858 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SCN9AQ15858 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
SCN9AQ15858 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SCN9AQ15858 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SCN9AQ15858 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SCN9AQ15858 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SCN9AQ15858 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SCN9AQ15858 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN9AQ15858 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN9AQ15858 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN9AQ15858 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN9AQ15858 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN9AQ15858 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN9AQ15858 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN9AQ15858 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN9AQ15858 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN9AQ15858 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN9AQ15858 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN9AQ15858 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN9AQ15858 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN9AQ15858 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCN9AQ15858 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCN9AQ15858 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCN9AQ15858 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCN9AQ15858 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCN9AQ15858 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SCN9AQ15858 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCN9AQ15858 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCN9AQ15858 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCN9AQ15858 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCN9AQ15858 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCN9AQ15858 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCN9AQ15858 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCN9AQ15858 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCN9AQ15858 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCN9AQ15858 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCN9AQ15858 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SCN9AQ15858 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
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