Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRIP13Q15645 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms