Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYTH1Q15438 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CYTH1Q15438 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CYTH1Q15438 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYTH1Q15438 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYTH1Q15438 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYTH1Q15438 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYTH1Q15438 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYTH1Q15438 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYTH1Q15438 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYTH1Q15438 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYTH1Q15438 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYTH1Q15438 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYTH1Q15438 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYTH1Q15438 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYTH1Q15438 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYTH1Q15438 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYTH1Q15438 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYTH1Q15438 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYTH1Q15438 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYTH1Q15438 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYTH1Q15438 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms