Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE3CQ15386 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE3CQ15386 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms