Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTF1Q15361 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTF1Q15361 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
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