Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NECTIN1Q15223 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NECTIN1Q15223 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
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