Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRD3Q15059 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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