Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMCO1Q147U7 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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