Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CUL4AQ13619 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CUL4AQ13619 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
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