Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
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