Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TOP3AQ13472 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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